微波对液体进行了透射、衍射、干射、偏振以及伴随着电磁波的能量，使液体水分子松弛改变了排列从而杀死全部细菌。60-85度杀死了一般菌落，98度杀死全部的芽孢菌。
微波杀菌也是利用了电磁场的热效应和生物效应的共同作用的结果。微波对细菌的热效应也是使蛋白质变化，使细菌失去营养，繁殖与生存的条件而死亡。微波对细菌的生物效应也是微波电场改变细胞膜断面的电位分布，影响了细胞膜周围电子和离子浓度，从而改变了细胞膜的通透性能，细菌因此也营养不良，不能够正常新陈代谢，细胞的结构功能紊乱，生长发育也受到抑制而死亡。此外，微波能够使细菌正常生长和稳定遗传繁殖的核酸RNA和脱氧核糖核酸DNA，是由若干氢键松弛，断裂和重组，从而诱发遗传基因突变，或染色体畸变甚至断裂。
格尔微波白酒液体杀菌机主要特点是：1、杀菌彻底不需防腐，长期存放不霉变，营养不流失并保持原有的色、香、味。2、微波杀菌比其它设备杀菌节约时间50%，比其它电设备节省电40%。3、没有工业废水，不污染环境，符合国家环保要求。4、微波还可对白酒催熟酿化，每催化一次减少窖存时间3-6个月。5、微波设备体积小占地面积少，加工速度快，维修操作方便是当前理想的杀菌设备。
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