微波袋装食品杀菌设备可对袋装食品封袋后进行杀菌，加入特殊装置从而使其塑料包装完好，达到食品杀菌的标准
食品微波杀菌机理包括热效应和非热效应两方面。
1．微波能的热效应
微波作用于食品时，食品表层和内部同时吸收微波能，温度升高。食品中污染的微生物细胞在微波场作用下，其分子也被极化产生高频振荡，产生热效应。温度的快速升高使菌体内蛋白质结构发生变化，从而失去生物活性，使菌体死亡或受到严重干扰而无法繁殖。
2．微波能的非热生化效应
已有不少实验证明微波对微生物的致死确实存在非热效应。微波的作用可使微生物生命代谢活动中的大量电子、离子和其它带电粒子的生物性排列组合状态和运动规律发生改变，造成微生物的生理活性物质发生变化。同时，电场也会使细胞膜附近的电荷分布改变，导致膜功能障碍，使微生物细胞的正常代谢功能受到干扰和破坏，使微生物的生长受到抑制，甚至停止生长或死亡。微波能还能使微生物生存所必须的水分活度降低，破坏微生物的生存环境。微生物细胞内的DNA和RNA吸收微波能后，会造成分子结构中的氢键松驰、断裂和重新组合，诱发基因突变，染色体畸变，从而中断微生物细胞的正常繁殖。
这样，在微波辐照使食品温度升高的热效应和蛋白质分子变性后失去生物活性的非热效应双重因素共同作用下，细菌、酵母菌等微生物将在短时间内被杀死，而且食品的色、香、味和营养成分并未因此受到损失。
微波干燥杀菌特点：
1、加热、烘干、杀菌快速均匀；
2、低温杀菌，杀菌彻底，能达到商业无菌；
3、干燥、烘干、杀菌一机多用，节能高效，比远红外设备节电30%以上；
4、安全卫生，无污染；操作灵活方便，易于控制，占地面积小。