营养钵的制作也可以分三个阶段：
第一阶段是营养土的配制。一般而言，要选择疏松、肥沃、易保水保肥、无病菌、无杂草种子的土壤表土2份，腐熟的有机肥1份掺匀配比。每立方米营养土加过磷酸钙1公斤，营养土按比例掺匀调好后过筛，遇天晴时充分暴晒杀菌。按最常用的直径11厘米、高10到12厘米的标准钵计算，一般每钵需营养土6-7两，营养土的配制除满足制钵外，还需要预留制体土量的2到3成做盖籽土用。
第二个阶段就是营养土的消毒。方法很简单，就是制钵前用福尔马林或多菌灵100倍液等杀菌剂对土喷细雾，并加盖薄膜密闭2-3天消毒杀菌。
第三个阶段就是制造钵，生产上最常用的既有自己做纸袋灌制，也有商品钵可供装土，营养土消毒杀菌后，等药味散尽即可装土入钵。一般就西瓜而言营养钵不宜过小，一般直径10厘米以上高10-12厘米，也不用过大，以省工节本。装土时掌握营养土的湿度，以手捏成团、落地即散为原则。钵底部捣实，以免松动易散，而钵上部则需要轻轻镇压，做到下紧上松，以利种子出苗。
一、防空钵：棉种质量差、播种质量低、苗床管理不善等，都会造成空钵缺苗。预防措施：播种前除去烂籽、嫩籽，选晴天晒种2～3天。播种时做到钵湿、种湿。土钵摆好后浇水，一次性浇透，结合药剂浸种，让种子吸足水分。每钵播种1～2粒，播种后盖
1～1.5厘米沙土。盖籽沙土要求细而湿润，为种子发芽出土创造湿润疏松的环境。
二、防烧苗：出苗后，晴天不注意及时通风，易引起高温烧苗，严重时棉苗还会被烫死，造成缺苗。预防措施：抓好揭膜通风降温措施，防止晴天中午前后出现极端高温危害棉苗。出苗后床温宜保持在25℃~30℃。
三、防寒害：揭膜后如不注意及时盖膜，气温急剧下降，易使棉苗受寒，通风口上的棉苗更易受寒甚至受冻。预防措施：在棉苗出土后到3叶期前， 根据气温的变化揭开两头通风炼苗，阴天则无须揭膜。平均气温16℃～18℃时，可进行日揭夜盖炼苗，一般于上午9时揭膜，下午5时重新盖膜。
四、防线苗：营养钵幼苗在膜内高温高湿的环境条件下，生长速度快，如管理不当就会旺长成为线苗，达不到壮苗要求。预防措施：一是出苗后及时间苗，每钵留壮苗1株，防止拥挤窜长。二是通风炼苗。适时适度降温降湿，减缓幼苗生长速度。三是使用壮苗素。在子叶平展至分心期，选择晴天中午用壮苗素250倍（或调节胺、助壮素
4000～5000倍）药液喷洒棉苗一次，待药液干后再覆膜保温，具有显著的壮苗效果。四是搬钵蹲苗。在第一片真叶展开时搬钵1次，降低温度和湿度，抑制旺长，促进侧根发育。如棉苗有旺长趋势，可增加搬钵次数，适当控制肥水，以控制疯长。
五、防病害：棉花幼苗主要病害是炭疽病和立枯病。如防治不力，将造成大量死苗。预防措施：首先要搞好营养钵土、盖籽土和种子的消毒工作。营养钵和盖籽土，用20%的稻脚青可湿性粉剂配成。